深度解析:癌症NGS基因檢測,該選哪種檢體?
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次世代定序(NGS)基因檢測是癌症精準醫療不可或缺的工具,能幫助醫生為病患找到最個人化的治療方案。然而,您選擇進行檢測的檢體類型——是傳統的腫瘤組織、便捷的血液(液態切片),抑或是特定情況下的體液(如胸水、腹水、腦脊髓液CSF)——將直接影響到檢測結果的準確性及能提供的資訊量。了解不同檢體的特性,對於病友和家屬積極參與治療決策至關重要。
傳統的腫瘤組織切片目前是癌症診斷的黃金標準,因其含有大量腫瘤細胞。但其最大挑戰在於侵入性,可能需要手術或穿刺,帶來不適和風險。實務上也常遇到組織量不足或品質不佳,導致需要重複採檢,增加病人負擔(例如有研究指出17.3%的肺癌案例需重複切片)。此外,腫瘤內部的基因變異可能存在異質性,單一小塊切片可能無法捕捉到所有關鍵變異。
相較之下,血液液態切片的最大優勢在於侵入性低且採檢容易,適合用於追蹤治療效果和監控復發。然而,血液中來自腫瘤的DNA(ctDNA)含量通常非常低,尤其在癌症早期,這可能導致遺漏變異的偽陰性。更複雜的是,正常白血球也可能帶有非腫瘤相關的後天變異(CHIP),容易被誤判為腫瘤變異,造成偽陽性。因此,血液檢測極度仰賴技術的高靈敏度(低LOD),需能精準偵測微量ctDNA並區分CHIP干擾。
值得注意的是,特定情況下的體液(如惡性胸水、CSF)在NGS檢測中展現巨大潛力。當腫瘤影響特定體腔時,這些體液中的游離DNA(cfDNA)濃度往往遠高於血液(胸水cfDNA中位數濃度可達278 ng/mL,血漿約20 ng/mL)。利用體液cfDNA進行NGS,其偵測到的基因變異種類和頻率(VAF)與腫瘤組織結果非常接近,偵測效率高,有時甚至更優。它兼具接近組織的高偵測潛力與相對低的侵入性,研究顯示胸水cfDNA NGS具有高準確率(98%)和敏感度(97.78%)。特別是針對腦膜轉移患者,CSF cfDNA幾乎能百分之百偵測到驅動基因突變,且變異濃度顯著高於血液。
總而言之,選擇最合適的NGS檢體,是高度「個人化」的決策。沒有單一最佳選項,最適合的取決於病患當下的具體情況,包括腫瘤位置、癌症分期、是否有特定體液積聚、病患身體狀況以及本次檢測的主要目的。這需要您與醫療團隊充分溝通,權衡不同檢體的優缺點與適用時機,共同找出效益最高、風險相對較低的採檢方案。
收聽本段音檔,深入了解不同NGS檢體的特性與適用時機,幫助您更主動、更明智地參與個人化的癌症治療決策過程!
主持人 : 歡迎回到節目!今天我們就是要來繼續深入討論,對於正在面對癌症的病友和家屬來說,一個蠻關鍵的問題,就是做次世代定序(NGS)基因檢測的時候,到底該選擇哪一種檢體會比較好呢? 我們知道,NGS 檢測是精準醫療很重要的一環,它能幫醫生找到更適合個人的治療方案。不過,你選的檢體——是傳統的腫瘤組織、抽血,還是像胸水、腹水這樣的體液——這個選擇真的會直接影響到檢測結果的準確性,還有你能得到多少資訊。
專家 : 沒錯,這點非常重要。我們手邊有一些資料跟圖表,就是要來幫助大家釐清,這些不同的檢體選項,各自有哪些優點和缺點。在不同的狀況下,到底哪一種檢體可能最適合你或你的家人,這真的需要好好了解一下。
主持人 : 那我們就從最傳統、大家最熟悉的「腫瘤組織切片」開始聊起好了。直接從腫瘤上面取一塊組織下來做檢測,聽起來應該是最直接、最準確的方式吧?而且資料上也說,它的腫瘤細胞含量高。
專家 : 理論上是這樣的。腫瘤組織切片目前確實還是診斷癌症的黃金標準,因為它裡面含有的腫瘤細胞數量最多。不過,它最大的挑戰就在於「取得的過程」。通常是侵入性的,可能需要手術或穿刺。病人得承受一些不舒服甚至潛在的風險。你看資料上的圖示也特別標示了「侵入性」。
主持人 : 對啊,而且我看到資料有提到,有時候那個切片取下來的組織量可能太少了,或者品質不太好,就沒辦法順利做 NGS 分析。像是國衛院有一個肺癌的研究就發現,好像有 17.3% 的案例因為組織不夠,還得再做一次切片。
專家 : 沒錯,這確實是實務上會遇到的狀況。需要重複採檢不僅增加了病人的負擔,也等於多一次副作用或風險的機會。另外還有一個情況叫做「腫瘤異質性」。簡單說,就是同一個腫瘤裡面,不同區域的基因變異可能長得不太一樣。
主持人 : 嗯... 像是粽子裡面,有些地方的餡料多一點,有些地方少一點,分佈不太均勻那樣?
專家 : 這個比喻不錯!所以如果你只切取一小塊組織來看,就可能有點「管中窺豹」,或是像你說的,剛好只吃到粽子的一小角。你取得的樣品,可能剛好沒包含帶有關鍵基因變異的那一部分。這樣一來,你就沒辦法看到整個腫瘤的全貌了。
主持人 : 這樣聽起來,雖然組織切片很直接,但限制也不少耶。所以後來才發展出「液態切片」,主要是抽血檢測嘛,對不對? 資料上也說它「侵入性低」、「抽血容易」。
專家 : 對。抽血確實很方便,相對來說也比較安全。而且它很適合用來追蹤治療效果,或監控是否有復發的跡象。但它主要的限制是,血液裡面來自腫瘤的 DNA(我們叫它 ctDNA),那個含量通常非常非常低,特別是在癌症比較早期的階段。
主持人 : 含量低的話,會怎麼樣啊?是不是就比較容易測不到,跟剛剛說的組織不夠有點像?
專家 : 有可能。量太少就可能測不到關鍵的基因突變,這會造成所謂的「偽陰性」——也就是明明有變異,但檢測卻沒偵測到。而且,血液裡其實還有超級多不是來自腫瘤的游離 DNA,很多是來自我們正常的白血球。這些白血球有時候自己會產生一些後天的基因變異,叫做 CHIP。
主持人 : CHIP... 是什麼啊?
專家 : CHIP 通常跟癌症本身沒有關係,但它在檢測的時候很容易被誤判,以為是從腫瘤來的變異。這就可能造成「偽陽性」。
主持人 : 哇,所以血液檢測聽起來方便,但在技術上的要求其實非常高耶!
專家 : 非常高。所以那個技術的靈敏度,也就是它能測到的最低限(我們叫 LOD, limit of detection)就變得很關鍵。靈敏度要夠高,才能抓到那些含量很低的腫瘤 DNA,避免偽陰性。有些比較厲害的技術,偵測極限可以達到 0.1%,甚至 0.01%。同時,好的技術也必須能夠分辨訊號是來自腫瘤,還是只是白血球的 CHIP 干擾。
主持人 : 嗯,了解。那除了組織和血液,還有其他的選擇嗎?我看到資料裡面有提到,像胸水、腹水,還有那個腦脊髓液,這些叫做「體液」的部分。這聽起來蠻特別的。
專家 : 對,這個方向我覺得潛力非常大。就是說,當腫瘤影響到某些特定的體腔,比如說肺癌產生了胸腔積液(胸水),或是癌細胞轉移到腦部影響到腦脊髓液(CSF)的時候,這些體液裡面常常會有非常多從附近的腫瘤掉出來的游離 DNA。
主持人 : 哦?而且濃度好像比血液裡的腫瘤 DNA 還要高?
專家 : 根據研究看起來是這樣。有研究就指出,像胸水裡面的 cfDNA(游離 DNA)濃度中位數可以達到每毫升 278 奈克(ng/mL)。這比血漿裡面常見的大約每毫升 20 奈克高了十幾倍!
主持人 : 哇塞,差這麼多!
專家 : 更重要的是,如果用這些體液來做 NGS,比方說把胸水離心後,用上清液(也就是 cfDNA)來檢測。結果發現,它找到的腫瘤基因突變種類,還有突變的頻率(VAF),也就是這個變異佔了多少比例,結果跟直接用腫瘤組織去驗非常非常接近!偵測出的效率很高,有時候甚至可能比組織檢測還要好。
主持人 : 等等等,所以你的意思是,它既有像組織檢測那樣高偵測率的潛力,又不像組織切片那麼侵入性,而是像抽血那樣相對容易取得?
專家 : 可以這麼說。資料上也提到了,它能「反映區域腫瘤狀況」、「相對組織容易取得」、「相對血液含有高腫瘤 DNA」。我看資料還有研究比較說,用胸水 cfDNA 做 NGS,那個準確率有到 98%,敏感度 97.78%,都比傳統用胸水裡面的細胞塊(Cell block)去驗還要高,而且比較不容易被血液細胞干擾。
主持人 : 沒錯,就是這個意思!所以這裡的重點是,大家以前可能只想到要拿組織或抽血。但其實像胸水這種以前可能比較被忽略的檢體,在特定情況下——比方說肺癌病人有積水了——它不但相對容易拿到,做基因檢測的效果搞不好比你花很多力氣切下來的組織還要好。
專家 : 這對於某些病人來說,真的會是一個很重要的選項。特別是像有腦膜轉移(LM)的病人。研究發現,用腦脊髓液(CSF)的 cfDNA 來檢測,幾乎是百分之百可以檢測出驅動基因突變!而且那個突變的濃度(VAF)比同時抽的血高非常多,能提供的資訊更直接、更豐富。
主持人 : 好的,我們很快地看過了組織、血液,還有體液這三種主要的 NGS 檢體。這資訊量真的不少耶!那講了這麼多,到底代表什麼?最後該怎麼選呢?
專家 : 我覺得最核心的概念就是「個人化選擇」。沒有哪一種檢體是絕對最好的,最適合的應該是「你當下那個狀況最需要的」。這需要綜合考量很多因素,比如說:
你看資料最後的圖示也強調了,要**「依病人狀況選擇」**。
主持人 : 哦,也就是說,這不是一個簡單的非 A 即 B 的選擇題,而是需要跟你的醫療團隊好好溝通,根據你或家人的具體情況,權衡利弊,找出一個效益最高、風險又相對比較低的採檢方式。
專家 : 正是如此。比方說,如果醫生懷疑有腦膜轉移,那腦脊髓液可能就是優先考慮的選項。如果有大量的惡性胸水,那用胸水 cfDNA 來檢測,效率可能就非常高。如果是需要方便的長期追蹤,那血液可能是個不錯的選擇。但如果是初次診斷,需要確定腫瘤到底是什麼類型,那組織切片還是有它的重要性。
主持人 : 嗯,了解了。所以搞懂不同檢體的特性跟適用時機,確實能幫助病友或家屬更主動地去參與治療的決策過程。
專家 : 對。
主持人 : 那最後,我們也留給大家一個問題思考一下:隨著檢測技術越來越進步,有沒有可能未來只靠某一種檢測,比方說血液檢測,靈敏度高到一個程度就可以取代其他所有方法了呢? 或者,其實是結合不同檢測方式的優點,才是未來個人化精準醫療的最終方向?
專家 : 嗯,這確實很值得我們持續關注。
主持人 : 好的,非常感謝您今天的詳細解說!
專家 : 謝謝大家收聽!